郵箱: mfqi@sinh.ac.cn
電話: +86-21-54920233
研究組主頁: https://qimeifanglab.github.io
所屬部門: 計算生物學(xué)重點實驗室
2023-至??今：中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所，研究員
2019-2023年： 美國麻省總醫(yī)院，博士后
2013-2019年： 中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院，遺傳學(xué)博士
2009-2013年： 華東理工大學(xué)，生命科學(xué)學(xué)士
組學(xué)，生物信息，染色體變異
通過開發(fā)和整合各種組學(xué)技術(shù)，實驗室聚焦于分析基因組變異對癌癥等疾病的影響；分析癌癥性別差異的分子機理以及探索可能的治療方案。
主要的研究方向為：
（1）整合多種組學(xué)數(shù)據(jù)，分析Y染色體丟失對癌癥以及克隆性造血進程的影響；
（2）通過基因組變異以及轉(zhuǎn)錄組等數(shù)據(jù)，分析癌癥中不同性別差異的分子機理；
（3）探索癌癥新型治療方案和開發(fā)新藥；
（4）開發(fā)二代測序以及單細胞測序染色體變異相關(guān)的計算方法，衡量染色體變異的進化以及對疾病的影響。
1. Qi M, Pang J, Mitsiades I, Lane AA, Rheinbay E*. Loss of chromosome Y in primary tumors. Cell 2023 Jul;186(14):3125-3136.e11.
2. Rheinbay E, Qi M, Bouyssou JM, Oler AJ, Thumm L, Makiya M, et al. Genomics of PDGFR-rearranged hypereosinophilic syndrome. Blood Advances 2023 Jun 13;7(11):2558-2563.
3. Qi M, Nayar U, Ludwig LS, Wagle N, Rheinbay E*. cDNA-detector: detection and removal of cDNA contamination in DNA sequencing libraries. BMC Bioinformatics 2021 Dec;22(1):611.
4. Qi M#, Li Z#, Liu C, Hu W, Ye L, Xie Y, Zhuang Y, Zhao F, Teng W, Zheng Q, Fan Z, Xu L, Lang Z, Tong Y, Zhang Y*. CGT-seq: epigenome-guided de novo assembly of the core genome for divergent populations with large genome. Nucleic Acids Res 2018 Oct 12;46(18):e107.
5. Wang J#, Qi M#, Liu J#, Zhang Y*. CARMO: a comprehensive annotation platform for functional exploration of rice multi-omics data. Plant J 2015 Jul;83(2):359-374.
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