2020年5月4日，國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Nature Metabolism在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所丁秋蓉研究組的研究論文“MRG15 orchestrates rhythmic epigenomic remodeling and controls hepatic lipid metabolism”。該研究發(fā)現(xiàn)MRG15作為一個(gè)進(jìn)化上保守的表觀調(diào)控因子在調(diào)控肝臟組織染色質(zhì)開(kāi)放狀態(tài)和脂代謝基因轉(zhuǎn)錄活性的節(jié)律性振蕩中行使重要的分子開(kāi)關(guān)作用。研究提示MRG15復(fù)合物在肝臟組織感應(yīng)外界營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)，并在營(yíng)養(yǎng)豐富環(huán)境下進(jìn)行有效能量?jī)?chǔ)存的過(guò)程中起重要作用。該研究為營(yíng)養(yǎng)過(guò)剩環(huán)境下脂質(zhì)代謝紊亂導(dǎo)致的代謝性疾病提供了新的分子靶標(biāo)。
地球自轉(zhuǎn)產(chǎn)生了晝夜交替，在長(zhǎng)期的進(jìn)化過(guò)程中，生物體產(chǎn)生了生物鐘節(jié)律系統(tǒng)，使得行為和生理進(jìn)程同步于光線的周期變化，以使能量的儲(chǔ)存和利用達(dá)到最優(yōu)狀態(tài)。前期研究發(fā)現(xiàn)全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)開(kāi)放和閉合，RNA聚合酶II的基因組結(jié)合和新生轉(zhuǎn)錄活性呈現(xiàn)明顯的晝夜節(jié)律。以肝臟為例，基因表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn)5-20%的基因在肝臟組織中存在24h的振蕩表達(dá)，且其中大多數(shù)基因?qū)Υx有重要調(diào)控作用，說(shuō)明染色質(zhì)重塑層面的晝夜節(jié)律調(diào)控在外周代謝組織中（如肝臟）對(duì)代謝基因的整體轉(zhuǎn)錄調(diào)控，繼而能量的儲(chǔ)存和消耗平衡非常重要。而外周代謝組織如何感應(yīng)外界營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)的節(jié)律性變化，并在染色質(zhì)重塑層面做出及時(shí)響應(yīng)是代謝領(lǐng)域有待回答的基本問(wèn)題。
MRG15是一個(gè)進(jìn)化上非常保守的表觀調(diào)控因子，前期被發(fā)現(xiàn)參與調(diào)控細(xì)胞增殖、DNA修復(fù)和個(gè)體發(fā)育過(guò)程。雖然MRG15基因附近的基因組區(qū)域在人類遺傳學(xué)中被鑒定為心血管疾病易感區(qū)域，但尚缺乏針對(duì)MRG15在代謝中的功能研究。研究人員在系統(tǒng)檢測(cè)MRG15基因組結(jié)合位點(diǎn)時(shí)發(fā)現(xiàn)，在肝臟組織中MRG15結(jié)合在多個(gè)重要脂代謝基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子區(qū)域，并同時(shí)發(fā)現(xiàn)一個(gè)有趣的現(xiàn)象：MRG15的基因組結(jié)合呈現(xiàn)明顯的節(jié)律性——在小鼠夜間進(jìn)食狀態(tài)下，MRG15結(jié)合的基因組位點(diǎn)超過(guò)1萬(wàn)個(gè)；而在白天非進(jìn)食狀態(tài)下，MRG15的基因組結(jié)合位點(diǎn)只有57個(gè)；而改變進(jìn)食時(shí)間能明顯改變MRG15基因組結(jié)合的節(jié)律性。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)，MRG15與基因組的節(jié)律性結(jié)合可促進(jìn)染色質(zhì)開(kāi)放，增強(qiáng)RNA聚合酶II的基因組結(jié)合，提高基因轉(zhuǎn)錄活性；而在MRG15敲除的肝臟組織中，全基因組范圍內(nèi)Pol II基因組結(jié)合的節(jié)律性被明顯破壞，多個(gè)脂代謝基因表達(dá)顯著降低，提示MRG15在節(jié)律性染色質(zhì)重塑和脂代謝基因表達(dá)調(diào)控中起關(guān)鍵作用。
研究人員進(jìn)一步針對(duì)導(dǎo)致MRG15節(jié)律性基因組結(jié)合上游機(jī)制進(jìn)行了研究，初步發(fā)現(xiàn)肝臟核受體LRH-1（又名NR5A2）部分介導(dǎo)了MRG15在脂代謝基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域的結(jié)合。LRH-1與MRG15存在蛋白相互作用，實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示LRH-1的蛋白表達(dá)量以及LRH-1與MRG15的蛋白相互作用明顯受節(jié)律和上游營(yíng)養(yǎng)信號(hào)調(diào)控，提示了一種經(jīng)由LRH-1調(diào)控MRG15基因組結(jié)合的上游營(yíng)養(yǎng)感應(yīng)機(jī)制。
當(dāng)通過(guò)CRISPR技術(shù)在成體小鼠肝臟組織里敲除MRG15進(jìn)而抑制這一過(guò)程后，小鼠能明顯抵抗高脂飲食導(dǎo)致的肝臟脂肪積累，改善代謝平衡。更有意思的是，F(xiàn)DA批準(zhǔn)的藥物阿加曲班（argatroban）被發(fā)現(xiàn)可以高親和力結(jié)合MRG15，抑制MRG15的功能，從而有效抑制肝臟脂滴積累，提示MRG15是一個(gè)成藥性較強(qiáng)的分子靶點(diǎn)。綜上，此項(xiàng)研究揭示了肝臟細(xì)胞感應(yīng)上游營(yíng)養(yǎng)信號(hào)，并在染色質(zhì)重塑水平作出及時(shí)響應(yīng)的一種傳導(dǎo)機(jī)制和其間關(guān)鍵銜接因子MRG15。
中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所韋余達(dá)、田程和趙永旭為該論文的共同第一作者，丁秋蓉研究員為論文通訊作者。這項(xiàng)工作得到了中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所應(yīng)浩研究員、上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院劉峰博士和復(fù)旦大學(xué)于文強(qiáng)教授的大力幫助。該研究還得到了科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金委及中國(guó)科學(xué)院等項(xiàng)目的資助，同時(shí)也得到了中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所公共技術(shù)平臺(tái)和動(dòng)物平臺(tái)的支持。
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s42255-020-0203-z
圖1. MRG15是調(diào)控肝臟節(jié)律性染色質(zhì)重塑和脂代謝基因表達(dá)的表觀分子開(kāi)關(guān)。
官方微信
